El esquema de seguimiento genético para los virus del resfriado y la gripe podría advertir sobre brotes peligrosos
Los nuevos esfuerzos para secuenciar rutinariamente los genes de los virus que causan infecciones respiratorias graves, como la influenza y el RSV, podrían conducir a tratamientos y vacunas más efectivos.
Salud
10 de enero de 2023
Imagen microscópica electrónica de partículas de coronavirus SARS-CoV-2
NIAID-RML/INSTITUTOS NACIONALES DE SALUD/BIBLIOTECA DE FOTOS CIENTÍFICAS
Las muestras de virus de personas con infecciones respiratorias graves, como la influenza y el RSV en el Reino Unido, se analizarán de forma rutinaria mediante secuenciación de ADN en un proyecto que podría conducir a mejores tratamientos y vacunas, así como a una advertencia más temprana de nuevos brotes peligrosos. La tecnología se probará en hisopos nasales almacenados de las pruebas COVID-19 a partir de este año y se implementará más ampliamente el próximo año.
El equipo detrás del proyecto, llamado Iniciativa de Microbiomas y Virus Respiratorios, dice que no conocen ningún plan similar en otras partes del mundo, pero espera que otros países adopten el mismo enfoque. Para fomentar esto, todos los métodos y datos estarán disponibles de forma gratuita.
“Esperamos que pueda usarse en todo el mundo”, dice Ewen Harrison del Instituto Wellcome Sanger en Cambridge, Reino Unido, quien lidera el proyecto.
Aunque ha sido posible secuenciar genomas virales durante décadas, no fue hasta la pandemia de COVID-19 que muchos países comenzaron a secuenciar de manera rutinaria miles de muestras, lo que demuestra cómo el virus SARS-CoV-2 que causa la enfermedad ha evolucionado más rápido. que lo esperado. Entre otras cosas, esta observación genómica permitió a los investigadores detectar las primeras variantes de omicrones y predecir correctamente que provocarían una gran ola de casos en todo el mundo.
“Por primera vez en la historia de la humanidad, la genómica a gran escala ha brindado a los gobiernos y políticos una advertencia de lo que sucederá durante una epidemia, y creo que este es un cambio realmente importante y profundo”, dice Harrison. «Eso es lo que creemos que es realmente importante para un mayor desarrollo».
Él dice que muchos otros virus, como el RSV, también pueden causar infecciones respiratorias graves, pero nuestra comprensión de ellos es extremadamente limitada. “Aparte de un poco de secuenciación del genoma en los casos de influenza, realmente no existe una vigilancia genómica de rutina para estos otros virus”, dice Harrison.
Actualmente, las pruebas comúnmente utilizadas para detectar virus que causan infecciones graves solo muestran de qué tipo son, como rinovirus o adenovirus, dice Judith Breuer, viróloga del University College London.
La secuenciación del genoma completo de un virus proporciona mucha más información que puede ser útil de muchas maneras. En primer lugar, puede ayudar a proporcionar el tratamiento más efectivo para las personas. Algunos tratamientos con anticuerpos para el COVID-19 pueden ser menos efectivos, como contra nuevas variantes, por lo que los médicos pueden recetar tratamientos alternativos de inmediato si saben que alguien tiene una de esas opciones.
También podría conducir a mejores vacunas. Dado que la secuenciación del SARS-CoV-2 ha demostrado que las variantes de omicron se han extendido por todo el mundo y se han vuelto dominantes, los refuerzos de ARNm se han actualizado para incluir dos de estas variantes para que las vacunas sean más eficaces contra ellas.
La secuenciación genética también puede revelar cómo se propagan los virus y, por lo tanto, ayudar a contenerlos. Por ejemplo, si solo sabe que dos personas en cuidados intensivos tienen una infección por rinovirus, no puede saber si la contrajeron en el hospital o en la comunidad, dice Breuer. La secuenciación puede decirnos si tienen exactamente el mismo virus y, por lo tanto, si es necesario mejorar las medidas de control de infecciones en los hospitales.
Por último, pero no menos importante, Harrison espera detectar nuevas enfermedades en una etapa temprana. Las posibilidades de hacerlo serán mucho mayores si otros países también realizan vigilancia genómica de rutina.
Secuenciar cualquiera de la docena o más de tipos diferentes de virus que pueden estar presentes en una muestra es técnicamente más difícil que solo secuenciar uno, especialmente cuando el objetivo es hacerlo con una prueba barata que se puede usar en cualquier parte del mundo. Es por eso que Harrison y su equipo refinarán su enfoque utilizando hisopos almacenados antes de pasar a probar hisopos frescos de pacientes en estado crítico, en colaboración con la Agencia de Seguridad de la Salud del Reino Unido. A largo plazo, existe la esperanza de ampliar la vigilancia no solo de los enfermos graves, sino también de otros tipos de virus.
Por ahora, los investigadores también planean secuenciar todo el material genético presente en múltiples muestras de hisopos. Este enfoque, conocido como metagenómica, les permitirá identificar todo tipo de virus, bacterias y hongos presentes, lo que les permitirá estudiar el microbioma respiratorio.
“Los métodos y tecnologías que están desarrollando Yuen y Sanger serán extremadamente útiles”, dice Breuer. «Esta es una iniciativa sorprendentemente importante».
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